Finale: 16.08.2004
| Medaille | Sportler | Nation |
| Gold | Aaron Peirsol | USA |
| Silber | Markus Rogan | Österreich |
| Bronze | Tomomi Morita | Japan |
| Rang | Sportler | Nation | Sekunden |
| 1 | Aaron Peirsol | USA | 54,06 |
| 2 | Markus Rogan | Österreich | 54,35 |
| 3 | Tomomi Morita | Japan | 54,36 |
| 4 | Lenny Krayzelburg | USA | 54,38 |
| 5 | Matt Welsh | Australien | 54,52 |
| 6 | Laszlo Cseh | Ungarn | 54,61 |
| 7 | Steffen Driesen | Deutschland | 54,63 |
| 8 | Marco di Carli | Deutschland | 55,27 |